吃魚油主要是攝取Omega-3的DHA及EPA，這些是人體無法合成的重要脂肪酸，對生理功能的維持相當重要。目前市面上的魚油的型態，往往取決於萃取方式的不同，大致來說，可分為TG型、EE型及rTG型等以下3種:
TG型魚油（Triglyceride form 三酸甘油酯型態）
TG型魚油是最傳統的魚油萃取模式，天然的魚肉脂肪主要以三酸甘油酯的型態存在，TG型魚油是萃取魚的皮下脂肪，經過基本的精煉過程（包括除臭、溶劑分離），盡可能維持魚油的三酸甘油酯型態，因此是3種型態的魚油中，最接近天然的魚油。
相較於其他2種魚油型態，TG型魚油的缺點是Omega-3的含量最低，一般含量約30~50%，不過因為TG型魚油最貼近天然魚油，因此人體生物可利用率較佳好，且加工程序最少，價格通常最低。
EE型魚油（Ethyl Ester Form 酯化型魚油）
由於TG型魚油的含量較低，為提升魚油Omega-3脂肪酸的含量，衍生出加工酯化的技術，藉由分離出魚油之中的多元不飽和脂肪酸，達到濃縮目的。
EE型魚油的Omega-3含量約50~70%，由於萃取技術較複雜，因此價格較高；然而，因為EE型魚油不是天然魚油的三酸甘油脂的型態，雖然含量較高，但吸收率反而較差。
rTG型魚油（Re-esterified Triglyceride 再酯化三酸甘油酯型態）
rTG型魚油為EE型魚油的進階版，使用更先進的萃取技術，達到以下2個目的：
- 一般可提高>80%的Omega-3 魚油含量。
- 同時具有三酸甘油酯之型態，吸收率不打折。
rTG型魚油不同以往有機溶劑萃取，而是使用超臨界萃取法，使用氣體，因此更能完整保存魚油的營養價值，但也因為技術門檻較高，因此rTG型魚油純度和價格都比較高，市面上宣稱魚油含量超過80%的魚油，大多是rTG型魚油。不論其含量或吸收率也是最高的，唯一的缺點就是價格也較貴。
